linux有各种发行版，都是基于linux内核的，可是为什么各个版本之间的2进制包都不兼容呢？就连ubuntu和debian都是。这是怎么回事呢？
打包的方式不一样，没办法，deb包不是二进制包，所有的二进制文件都是兼容的，是可以直接运行的，你确定你说的不兼容是二进制包，还是deb包？
二进制文件都是兼容的，甚至和同样基于linux的android也是兼容的。但软件包的格式是不一样的，主要有debian和红帽两个体系。
找这么说deb解压打成rpm一样可以在fedora上运行了
虽然同是linux内核但还是很大不同的，就像是windows都是（windows）NT内核，但每款操作系统还是很多的不同啊，就像XP，win7，win8这三款的差别
deb在debian体系是通用的吧，只是各个桌面版依赖不同。
理论上是可以的，但实践起来会有各种问题，比如依赖库版本的匹配，相关文件的路径规范等等，各种细节问题都会影响各种包之间的相互转换，所以，即使有ｒｐｍ和ｄｅｂ之间转换的工具，它们其实也不完美，不过需要包格式转换的场景也不多吧，各种体系目前都提供了海量的软件/库供选择
我没理解兼容这个词的意思，如果按照我理解的兼容，linux不但各个发行版之间，而且还在各个版本号之间兼容，而且还能在各种框架之间兼容。
我一个一个的说：
1、各个发行版之间兼容：
先举个例子，chrome 浏览器给了deb包，rpm包，在archlinux上用的时候，就是把rpm包解开，然后把文件位置放好就可以了。可以参考chrome 的AUR 中的安装脚本。
再举个例子，你在fedora下面，先安装一个apt-get 这个是有rpm包的，去骨头源就能找到，然后你apt-get 更新索引，然后再安装一些必要包，然后重启，发现fedora已经变成debian了。
包管理器打的包，一般分为三部分，1、程序本身2、安装卸载等脚本3、依赖等软件信息。 然后压缩在一起。你解压开然后取出你想要的部分就可以了。关于“手工解压(压制)deb(rpm)包”的方法，网上有很多，随便搜搜就能了解到。
所以，软件包在各个发行版之间的兼容性是非常强的。
2、各个版本号之间的兼容：
一个linux系统里面一个库可以有很多版本的。在实验室，我推荐使用fedora的一个原因就是，骨头源非常好用。因为科研用的代码经常失去维护，有的非常古老，需要很老的库才能运行起来，这个事情，可以去骨头源，找到相关的rpm包，然后用rpm命令安装上，这个时候，很多库就并存着很多版本，然后程序就能运行起来了。有种穿越时空的感觉。
如果库的版本号还没差那么多，那么ln -S 软链接是在linux里面比较常用的一个方法，只要是so文件里面的api还能兼容，其实可以用创建软链接的方法，来满足程序对库的版本号的要求。
还有就是最典型的kernel了，kernel的跨版本号的能力也是非常强大的，如果你是滚动升级版，你就会发现，其实kernel差几个版本号，根本就是很正常的事情。比如最近，3.8～3.14 那个kernel扔进去都能把系统带起来。
3、各种cpu框架之间的兼容
这个是体现linux兼容性最牛的地方。通过file 命令可以看到一个文件的文件类型，如果是可执行体，那么就有运行的指令集，如果运行这个文件的指令集刚好和你计算机的指令集不一样。那么在linux下也是可以解决的。
使用qemu-static-user，根据gentoo wiki配置好这个东西。然后选好你执行文件的指令集，然后注册到内核中，然后就可以运行这个异构的执行体了。其执行效率和本地程序相当。
linux的兼容性之强大，所以才有了如此灵活的特性。最后再举个例子。
skype只发32位二进制包，那么可以通过multilib让其在64位系统中运行。当然也可以通过我刚才提到的qemu-static-user在arm上运行。
matlab基于java，随matlab光盘中给的java是32/64位java，但是由于我们伟大的openjdk项目，将其中附赠的java替换掉，就可以在arm或是mips等其他cpu结构中运行了。
就是只要不存在依赖问题，各个版本的安装包解压后都可以正常运行了，就是不同cpu架构不同也可以。
大神，可以讲解或推荐个书籍说一下软件运行兼容性是怎么回事？
不知道，linux里面好像就没有兼容这个概念，这都是用windows用出后遗症的说法。维护发行版的那些package monkey 就从源代码上解决了所谓的“兼容性”问题。
其实依赖问题也不是什么大问题，反正可以多版本共存。而且实际情况来看，绝大部分库都能做到跨着几个版本号，还能用情况。而依赖带来的好处是显而易见的，就是功能的去耦合，从而在很多方面提高了linux系统的效率。